台湾高等检察署星期五(11月6日)起诉无党籍立法委员高金素梅和三名助理，指控高金素梅涉嫌接受中国资金约新台币1.7亿元，在台湾发展组织，违反《国家安全法》和《贪污治罪条例》。检方对高金素梅求刑14年，对疑似已偷渡出境的前办公室主任张俊杰求刑15年。高金素梅否认所有指控，并表示将在审判中提出证据，证明自己清白。
高检署星期一以被告身份传唤高金素梅，并收押两名助理，随后侦结此案。检方以《国家安全法》中“为大陆地区公务机构发展组织”罪，以及《贪污治罪条例》中“职务上行为收受贿赂”等罪嫌，起诉高金素梅等四人。
高金素梅是台湾泰雅族原住民，2001年以无党籍身份当选原住民选区立法委员至今。
高检署说，高金素梅利用立委职权，就职务上行为，尤其是反军购、两岸、外交与国防等重要议题，依中共授意指示在国会配合发声，影响议事进行，内外勾连，所犯情节极为重大，且侦查中推诿卸责，毫无悔意，建请法官从重处以有期徒刑14年。
高检署也指出，张俊杰以接受中共捐赠原乡部落建设经费为名，透过亲友账户等管道，将新台币1亿7千多万元资金汇入台湾，引进中共资源发展组织。
台湾自由时报报道，检调人员查出，高金素梅明知张俊杰长期提供巨额资金或中共直接捐赠资金为其竞选，她却涉嫌依中共官员及派遣人员授意指示，在立法院内召开反日记者会、对台湾驻日代表处质询删除预算、质询反对军购、透过程序委员会委员身份影响法案审议等，严重影响议事运作；此外，她也针对两岸、外交等议题进行抗议发声，对台湾主权完整、国家安全及社会安定造成重大危害。
台湾中央社的报道说，检调人员查出，高金素梅、其办公室前后任主任张俊杰、陈智葟及助理林怡君等4人自2005年到2016年，将其部落工作队及国会团队统合称“祖灵之邦团队”，以“一套人马，两块招牌”方式运作，由张俊杰、陈智葟同龄团队竞选、问政及联系原乡部落，林怡君则在台湾与中国大陆两边穿梭，接受中共官员指示并传达。
报道说，张俊杰今年6月即遭台北地方检察署以涉嫌诈领助理费起诉，在移到法院审理后以新台币1,000万元交保并佩戴电子手环监控行踪，但他在9月6日破坏手环逃匿，疑似已从基隆偷渡出海。
对于被高检署起诉，高金素梅当天在其脸书帐号上发表声明强调自身清白，否认起诉书中对她的所有指控。
“我没有为中共发展组织，也没有收取任何陆资，起诉书所载犯行均非事实，不能因查缉张俊杰逃亡失利，就草率起诉，转移焦点。”她说，起诉书提到她因靖国神社事件而赴日本及联合国抗议、反对军购等，都是她一贯主张，“并非中共授意，也没有任何对价，更没有一毛钱流入我的口袋。”
她也表示，将在审判中提出相关证据，捍卫自身清白，“决不妥协”。
在高金素梅被检调约谈后，北京当局指责台湾执政的民进党政府是在“操弄司法”，“罗织罪名”，破坏两岸交流合作。